linux命令行下使用R语言绘图 linux命令行下使用R语言绘图实例讲解

时间:2021-03-16 solohac 人气:0

想了解linux命令行下使用R语言绘图实例讲解的相关内容吗，solohac在本文为您仔细讲解linux命令行下使用R语言绘图的相关知识和一些Code实例，欢迎阅读和指正，我们先划重点：linux命令行下使用R语言绘图,R语言绘图，下面大家一起来学习吧。

使用系统：centos 6.4 64bit

在R语言中可以使用png()等函数生成图片，例如： png("aa.png")可以生成图片。

但是如果你是通过shell远程连接到系统上，可能会碰到如下错误：

> png("aa.png")

错误于.External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width, :

无法打开PNG设备

此外: 警告信息：

In png("aa.png") : 无法打开链结到X11显示''

分析：

打开R控制台，输入capabilities()，可以看到：

> capabilities()
  jpeg   png   tiff  tcltk   X11   aqua http/ftp sockets 
  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE   TRUE   TRUE 
 libxml   fifo  cledit  iconv   NLS profmem  cairo 
  TRUE   TRUE   TRUE   TRUE   TRUE  FALSE  FALSE

可以看到png为false，因为生成图片需要X11，但是shell是没有X11的。

怎么解决：

1.在X11模式下执行R语言命令，也就是在linux的桌面。如果你只是在桌面上画画图，那选择这个方式就可以了。

2.不使用X11生成,使用图形渲染库Cairo。比如我，需要用脚本，根据实时数据生成统计图，那么用这个方式就很方便。

安装：

启动R控制台

安装

install.packages("Cairo")

会让你选择安装镜像

--- 在此連線階段时请选用CRAN的鏡子 ---
CRAN mirror 
 
 1: 0-Cloud            2: Argentina (La Plata)    
 3: Argentina (Mendoza)      4: Australia (Canberra)    
 5: Australia (Melbourne)     6: Austria          
 7: Belgium            8: Brazil (BA)        
 9: Brazil (PR)         10: Brazil (RJ)        
11: Brazil (SP 1)        12: Brazil (SP 2)       
13: Canada (BC)         14: Canada (NS)        
15: Canada (ON)         16: Canada (QC 1)       
17: Canada (QC 2)        18: Chile           
19: China (Beijing 1)      20: China (Beijing 2) 
选一个北京的好了：20

安装出错

configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo (http://www.cairographics.org/) and/or set CAIRO_CFLAGS/LIBS correspondingly.

所以我们需要先在系统中安装cairo库

yum -y install cairo* libxt*
安装完成之后，重新执行：install.packages("Cairo")
installing to /usr/local/lib64/R/library/Cairo/libs
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (Cairo)
 
下载的程序包在
‘/tmp/RtmpNlGyf3/downloaded_packages'里
更新'.Library'里的HTML程序包列表
Making 'packages.html' ... 做完了。

安装成功。

加载Cairo后，查看支持：

> library(Cairo)
> Cairo.capabilities()
  png  jpeg  tiff  pdf  svg   ps  x11  win raster 
 TRUE FALSE FALSE  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE  TRUE 
说明已经支持用cairo生成图片了。
例如可以使用如下命令生成PNG：
CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

附上一个测试小程序，主要为了说明用法：

#vim test.r
library(Cairo)

CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

plot(5,4)

保存后执行：

[root@localhost ~]# Rscript test.r 
 
R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"
Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
> library(Cairo)
> CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)
> plot(5,4)
>

在当前目录下可以看到生成了图片

[root@localhost ~]# ll
总用量 84
-rw-r--r--. 1 root root 6832 5月 13 10:33 out.png
-rw-r--r--. 1 root root  71 5月 13 10:32 test.r

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