R语言density plot密度图 R语言作图之density plot(密度图)的制作步骤
生信了 人气:0上次分享了小提琴曲线(violin plot)的作图方法,今天小仙同学给大家介绍一下如何用R画出漂亮的密度图(density plot)。
Step1. 绘图数据的准备
首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,把excel保存成csv格式。
数据的格式如下图:一列表示一种变量,第一行是列名
Step2. 绘图数据的读取
data<-read.csv(“your file path”, header = T)
#注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用 header=F
Step3.绘图所需package的安装、调用
install.package(“ggplot2”)
#注释:ggplot2是目前公认绘图很强的一个安装包,如果已经安装,这句就不需要啦
library(ggplot2)
#注释:package使用之前需要调用(每次用前都要调用哦)
Step4绘图
p<-ggplot(data, aes(x = weight))
#注释:x轴表示weight,y轴表示频率就不需要指定啦
p + geom_density(color = “black”, fill = “gray”)
#注释:color是线条的颜色参数,fill表示填充颜色
Step5.美化
p + geom_density(aes(color = sex))
#注释:按照性别不同组改变线条颜色
p + geom_density(aes(fill = sex), alpha=0.4)
#注释:按照性别不同组改变填充颜色,alpha表示调整透明度
到这里你已经可以画出比较高B格的density plot了,不过有些同学可能有
特殊的要求,比如把两组的平均值画出来,那本小仙再小秀一下?
1.准备平均值数据并读取
mean<-read.csv(“your file path”)
2.画图
p+ geom_density(aes(color = sex), alpha=0.4)+
geom_vline(data = mean, aes(xintercept = mean, color=sex),linetype=“dashed”)
#注释:前面是和之前一样作图语句,在后面直接加上这一句就好啦,xintercept表示x轴截断线,dashed表示是虚线
好啦,今天的分享就到这里了,希望可以帮助到大家。有什么新的作图要求,可以留言给我哦!
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